Curso Bioinformática
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1. Introducción a la bioinformática (5h)
- Intentando definir la bioinformática
- Relevancia actual de la bioinformática
- Formatos de ficheros y bases de datos
- Proveedores institucionales de datos
- Herramientas locales y de internet
2. Herramientas computacionales (24h)
- Sistemas operativos alternativos: introducción a unix/linux
- Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes)
- Lenguajes de programación: Perl como ejemplo
- Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl
- Herramientas estadísticas: R como ejemplo
- Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo
- Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo
- Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos
3. Algoritmos (6h)
- Búsqueda de patrones en secuencias
- Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica
- Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal
4. Bioinformática aplicada (15h)
- Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST)
- Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones)
- Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR)
- Minería en datos masivos (high throughput screening)
- Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO)
- Análisis de la variación (polimorfismos)
- Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias)
- Biología estructural tridimensional: PDB
DURACIÓN
50 horas
HORARIO
De lunes a viernes 18 a 21 h, excepto 7 de mayo de 18 a 20 h.
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